Nhà khoa học Nga điều tra phản ứng miễn dịch đối với các biến thể COVID

Các nhà nghiên cứu của Đại học HSE đã đánh giá sự hiệu quả của phản ứng miễn dịch tế bào T đối với 11 biến thể của SARS-CoV-2 . Các nhà nghiên cứu đã sử dụng kết quả của họ để phát triển cổng Atlas COVID-19 của tế bào T (T-CoV).
Sự xuất hiện liên tục của các đột biến SARS-CoV-2 mới cho phép vi rút lây lan hiệu quả hơn và trốn tránh các kháng thể. Tuy nhiên, vẫn chưa rõ liệu các chủng vi khuẩn mới có khả năng né tránh miễn dịch tế bào T hay không - một trong những tuyến phòng thủ chính của cơ thể chống lại COVID-19.

Sự phát triển của phản ứng miễn dịch tế bào T bị chi phối phần lớn bởi các yếu tố di truyền, bao gồm các biến thể trong gen phức hợp tương hợp mô chính (còn được gọi là HLA). Mỗi biến thể gen HLA có một phân tử tương ứng xác định một bộ peptit (protein) cụ thể của vi rút.
Hiệu quả của việc phát triển miễn dịch tế bào T đối với COVID-19 ở mỗi người. Tùy thuộc vào các phân tử HLA, hệ thống miễn dịch của một số người sẽ xác định và tiêu diệt một loại virus đột biến với hiệu quả tương tự như dạng cơ bản của vi rút. Ở những người khác, phản ứng kém hiệu quả hơn.

Nghiên cứu được thực hiện bởi một nhóm các nhà khoa học từ Khoa Sinh học và Công nghệ Sinh học của Đại học HSE và Viện Hóa học Sinh vật thuộc Viện Hàn lâm Khoa học Nga, bao gồm Stepan Nersisyan, Anton Zhiyanov, Maxim Shkurnikov và Alexander Tonevitsky. Họ đã đánh giá các đặc điểm di truyền của sự phát triển miễn dịch tế bào T đối với 11 biến thể SARS-CoV-2 chính bằng cách phân tích các biến thể gen HLA phổ biến nhất. Các nhà nghiên cứu đã sử dụng kết quả của họ để phát triển cổng Atlas COVID-19 của tế bào T.
Các nhà nghiên cứu đã sử dụng tin sinh học để đánh giá ái lực liên kết của hàng trăm biến thể phân tử HLA và hàng chục nghìn peptit virus của các biến thể SARS-CoV-2 chính (Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon, Zeta, Eta, Theta, Iota, Kappa và Lambda). Nhóm nghiên cứu đã xác định các alen HLA hiển thị tập hợp các peptit virus đã được xác định thay đổi đáng kể nhất. Theo các nhà khoa học, các biến thể đột biến có thể gây ra nguy cơ cao hơn cho những người có các alen này.

'Miễn dịch tế bào T hoạt động sao cho sự biến đổi trong các phân tử HLA và các thụ thể của tế bào T ngăn không cho vi-rút trốn tránh phản ứng miễn dịch. Nghiên cứu của chúng tôi không tìm thấy một biến thể kiểu gen HLA nào bị ảnh hưởng tiêu cực bởi các đột biến vi rút theo một cách đáng kể. Điều này có nghĩa là ngay cả trong điều kiện hiệu quả của kháng thể suy yếu, khả năng miễn dịch tế bào T vẫn tiếp tục hoạt động hiệu quả '', Aleksander Tonevitsky, Trưởng Khoa Sinh học và Công nghệ Sinh học tại Đại học HSE, nhận xét.

Bằng cách sử dụng máy học, họ đã xây dựng một mô hình đánh giá toàn diện về sức mạnh của phản ứng miễn dịch tế bào T với COVID-19: nếu tập hợp các alen HLA-I cho phép trình bày hiệu quả các peptit của vi rút SARS-CoV-2 , những cá nhân đó có rủi ro thấp, trong khi những người có khả năng trình bày kém hơn có rủi ro cao hơn (trong khoảng từ 0 đến 100). Để xác thực mô hình, kiểu gen của hơn 100 bệnh nhân bị COVID-19 và hơn 400 người khỏe mạnh (nhóm đối chứng) đã được phân tích.